La forma correcta de hacerlo es abriendo el Windows PowerShell con permisos de administrador y escribir lo siguiente:
DISM.exe /online /Set-Edition:"ServerStandard" /AcceptEula /ProductKey:XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX
Donde XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX es la llave de producto.
Después de reiniciar el equipo, veras que ha desaparecido el texto que indica que tu versión no esta registrada.
Deberás ingresar a propiedades, después a Activar licencia y escribes de nuevo la misma licencia que usaste en el Windows PowerShell.
Esto debería ser suficiente para tener de nuevo la instalación completa y correcta de tu Windows Server 2012.
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